Post on 21-Oct-2020
1 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Esborrany de procediment d'homologació per a Sistemes d'Informació d'Anatomia Patològica (SIAP)
2 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Índex
1. Introducció ...................................................................................................................... 4
1.1. Guia de conformitat ................................................................................................. 4
2. Funcionalitats ................................................................................................................. 5
2.1. Idioma ...................................................................................................................... 5
2.2. SNOMED CT ........................................................................................................... 5
2.2.1. Gestió de subconjunts de SNOMED CT. ........................................................... 5
2.2.2. Descripció completa en termes SNOMED CT. .................................................. 8
2.2.3. Gestió d’extensió catalana de SNOMED CT. .................................................... 8
2.2.4. Altres extensions. Permetre als usuaris gestionar extensions locals. ................ 9
2.2.5. Actualització dels subconjunts, extensions. ....................................................... 9
2.2.6. Importació de publicacions noves i d’actualitzacions ....................................... 10
2.2.7. Importació d’extensions ................................................................................... 10
2.2.8. Accés a la informació històrica ........................................................................ 11
2.2.9. Mostrar informació detallada de la procedència o pertinència del terme referit envers extensions i subconjunts en els que estigui referenciat. .................................... 12
2.2.10. Indicar les relacions que te el terme trobat amb altres termes i permetre navegar per ells. ........................................................................................................... 12
2.3. Accés segur i confidencialitat de les dades ............................................................ 12
2.4. Integració amb sistemes ........................................................................................ 13
2.5. SCTID. ................................................................................................................... 13
2.5.1. El Tipus de dades SCTID ................................................................................ 13
2.5.2. Representació del SCTID ................................................................................ 13
2.5.3. El SCTID i les extensions ................................................................................ 14
2.5.4. Restriccions dels SCTID .................................................................................. 15
2.5.5. Dígit de control ................................................................................................ 15
2.5.6. Identificador de partició ................................................................................... 16
2.5.7. Espais de noms d’una extensió ....................................................................... 16
3 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
2.5.8. Dígits de l’identificador de cada entitat ............................................................ 17
2.5.9. SCTID - Exemples ........................................................................................... 17
2.6. Mitjans de distribució ............................................................................................. 18
2.7. Formats d‟arxiu ...................................................................................................... 18
2.7.1. Estructura dels directoris i convencions de denominació ................................. 19
2.7.2. Informació sobre la versió de la terminologia ................................................... 20
2.7.3. Càlcul del dígit de control ................................................................................ 20
2.8. Descripció completa (Fully Specified Name, FSN) ................................................. 22
2.9. Terme preferit ........................................................................................................ 22
2.10. Sinònims ............................................................................................................ 22
2.11. Definicions de relacions i conceptes ................................................................... 23
2.11.1. Relacions IS_A (ES UN/UNA) ......................................................................... 23
2.11.2. Relacions d’ atributs ........................................................................................ 23
2.12. Importació: Formats de publicació actualitzats ................................................... 25
2.13. Actualització a partir dels arxius de distribució ................................................... 25
2.14. Importació d‟extensions ...................................................................................... 26
3. Glossari ........................................................................................................................ 28
4. Referències .................................................................................................................. 31
4 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
1. Introducció
Aquest document és l‟especificació de funcionalitats per a un procés de conformitat amb la
interoperabilitat d‟un Sistema d‟Informació d‟Anatomia Patològica (a partir d‟ara
l‟anomenarem SIAP), entenent que marcarà les directrius que qualsevol d‟aquests
programes informàtics haurà de complir per a poder ser usat dins dels sistemes dels centres
del SISCAT.
Per a establir el procediment d‟homologació d‟un SIAP, s‟ha partit del document de
requeriments funcionals inicials exigibles, donant per descomptat que el SIAP cobreix a
nivell de circuits tot el que és necessari per a treballar en un servei d‟anatomia patològica i
no defineix, en aquest sentit, cap funcionalitat específica. Els requeriments funcionals que
s‟exigeixen explícitament estan agrupats en tres blocs: idioma, seguiment i aplicació de
SNOMED CT, seguretat i confidencialitat, i finalment, la integració amb els sistemes
d‟explotació.
En aquesta proposta hem pres com a referència les normes PHR-S FM, així com els
documents oficials de l‟estàndard SNOMED CT.
1.1. Guia de conformitat
Aquest document permet servir com a eina per donar la conformitat als sistemes SIAP, per a
això es defineixen un conjunt de requeriments funcionals, aquests requeriments funcionals
tenen un ordre de prioritat que defineix l'obligatorietat o opcionalitat del requeriment
funcional, els possibles valors són:
OBL: Requeriment funcional d'obligat compliment per a tenir la conformitat OPC: Requeriment opcional, es valorarà positivament el compliment d'aquests requeriments.
Cada requeriment funcional està definit per un objectiu i la seva descripció, acompanyat si
es considera oportú d'un exemple.
La guia de conformitat disposa d'un glossari de termes sobre SNOMED CT que permet
conèixer amb profunditat les característiques tècniques de SNOMED CT.
5 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
2. Funcionalitats
2.1. Idioma
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Definir l ‟idioma de l ‟interfície d‟usuari del SIAP.
Descripció: Qualsevol SIAP haurà de disposar d‟una interfície d‟usuari en català. Això vol
dir que tots els menús de l‟aplicació informàtica: textos, etiquetes, missatges, etc., que
interactuïn amb l‟usuari, hauran d‟estar en aquest idioma.
El SIAP podrà oferir la possibilitat de configurar altres idiomes, però és obligatori disposar
del català.
2.2. SNOMED CT
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El SIAP ha de categoritzar mitjançant l‟estàndard SNOMED CT.
Descripció: El SIAP haurà de ser capaç de bloquejar la forma de codificar actual (SNOMED
II, CIE-9, etc.) i obligar a l‟ utilització de SNOMED CT pels registres dels nous casos
d‟estudi, sense perdre l‟ informació de la codificació anterior i tot el seu històric.
El SIAP haurà de tenir la possibilitat de treballar amb termes SNOMED CT. Per allò es
sol·licita disposar de les següents funcionalitats integrades:
2.2.1. Gestió de subconjunts de SNOMED CT.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El SIAP podrà treballar i gestionar subconjunts SNOMED CT.
Descripció: Els subconjunts permeten especialitzar el catàleg segons les necessitats
territorials o les especialitats mèdiques o farmacològiques. El SIAP haurà de poder treballar
amb aquests subconjunts, permetre la seva actualització i manteniment, així com deixar
definir nous subconjunts d‟àmbit més local.
Aquesta gestió de subconjunts de snomed CT ha de ser seguint les definicions de
subconjunts definits per snomed CT (Veure glossari termes)
2.2.1.1. Subconjunt nucli SNOMED CT:
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Facilitar l‟accés al nucli principal de SNOMED CT
6 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Descripció: Un Sistema d‟Informació d‟Anatomia Patològica ha de ser capaç de treballar
amb el catàleg base de SNOMED CT, en qualsevol de les seves versions.
Exemples: Accés a totes les funcionalitats del catàleg general de SNOMED CT: anatomia,
principis actius, etc.
2.2.1.2. Subconjunt anatomia definit pel comitè editor de Catalunya.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El comitè editor de Catalunya (que en el cas d‟Anatomia Patològica és la comissió
snomed CT) definirà i gestionarà el subconjunt d‟anatomia patològica.
Descripció: Un subconjunt és un conjunt de conceptes, descripcions o relacions apropiades
per a un idioma, dialecte, país, especialitat, organització, usuari o context en particular. El
comitè editor de Catalunya s‟encarregarà de crear i actualitzar aquest subconjunt amb el
propòsit d‟especialitzar-lo en conceptes d‟Anatomia Patològica.
El SIAP ha de ser capaç d‟utilitzar el subconjunt d‟anatomia patològica definit pel comitè
editor de Catalunya.
Exemples:
CONCEPTID SNOMEDID
103007 L-37904
106004 T-D8602
107008 T-F1102
108003 T-49723
110001 T-71210
111002 T-B7000
116007 T-03694
2.2.1.3. Taula de subconjunts i estructura dels arxius
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Definir l‟estructura d‟emmagatzematge dels conceptes pels nous subconjunts.
Descripció: El SIAP ha de tenir l‟estructura d‟arxius que es defineixen en el manual de
SNOMED CT (veure el glossari del document). Per a tots els subconjunts s‟utilitza una
7 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
estructura d‟arxiu comú. Aquest enfocament simplifica l‟estructura de la publicació i el procés
d‟instal·lació per tots els usuaris de SNOMED.
Per la publicació dels subconjunts s‟utilitzen dues taules:
Taula de Subconjunts:
Cada fila d‟aquesta taula descriu una publicació d‟un subconjunt. Aquesta taula inclou els subconjunts de SNOMED CT que s‟agrupen a la Taula de Membres del Subconjunt.
Taula de Membres del Subconjunt:
Cada fila d‟aquesta taula representa un membre d‟un subconjunt. El membre pot ser un concepte o una descripció. Aquesta taula pot agrupar un o més subconjunts.
2.2.1.4. Subconjunt mini glossari definit pel comitè editor de Catalunya.
Rang de prioritat: OPC
Objectiu: Utilitzar el mini glossari amb els termes més rellevants en anatomia patològica.
Descripció: El mini glossari no és un nou subconjunt, sinó un grup molt reduït dels termes
més rellevants que s‟utilitzen en anatomia patològica.
Exemple:
ID SNOMEDID DESCRIPTIONID TERM
381 T-01000 941437019 pel
382 T-0100A 878355014 empelt de pel
383 T-01600 1021019016 ungla
384 T-02652 1016707019 pell de la cara palmar de la mà
385 T-02865 1333546015 pell de la planta del peu
386 T-03000 1019359011 teixit subcutani
387 T-04000 1031025011 mama
388 T-04040 1001883019 secreció mamària
389 T-04100 903078015 mugró
390 T-10000 907837015 sistema múscul-esquelètic
8 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
ID SNOMEDID DESCRIPTIONID TERM
391 T-11001 1064859015 os (òrgan)
392 T-12711 851681012 cap femoral
2.2.1.5. Subconjunts de domini i subconjunts d’idioma en SNOMED CT.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Possibilitat de treball amb els idiomes català i castellà en SNOMED CT.
Descripció: El SIAP ha de poder utilitzar la terminologia SNOMED CT tant en la versió
catalana com castellana.
Les descripcions dels conceptes son els termes o noms assignats a un concepte de
SNOMED CT. En aquest context, "terme" significa una frase utilitzada per nombrar un
concepte. Un identificador de descripció (DescriptionID) únic identifica una descripció.
Diferents descripcions poden associar-se amb un concepte identificat pel seu ConceptID.
2.2.2. Descripció completa en termes SNOMED CT.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Cada concepte haurà de disposar d‟una descripció complerta.
Descripció: El propòsit s‟ identifica de manera unívoca un concepte i aclarir el seu significat;
no necessariament representa la frase més utilitzada o natural per descriure aquest
concepte. De la mateixa forma, un concepte pot també tenir un terme preferit, així com
comptar amb sinònims.
Exemple: Algunes de les descripcions associades amb el ConceptID 22298006:
Descripció completa (Fully Specified Name): Infart de miocardio (trastorn) DescriptionID 898593010 Terme preferit: Infart de miocardi DescriptionID 898589016 Sinònim: Infart cardíac DescriptionID 898591012 Sinònim: Atac de cor DescriptionID 898592017 Sinònim: Infart de cor DescriptionID 37441018
Totes les descripcions mencionades tenen un DescriptionID únic i totes estan associades a
un únic Concepte (i al seu ConceptID únic 22298006).
2.2.3. Gestió d’extensió catalana de SNOMED CT.
Rang de prioritat: OBL
9 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Objectiu: El comitè editor de Catalunya pot definir un conjunt de termes que formen part del
subset ap de Catalunya.
Descripció: SNOMED CT és una terminologia clínica detallada, amb ampli abast. No
obstant, alguns grups d‟usuaris requeriran conceptes, descripcions o subconjunts
addicionals per cobrir les necessitats nacionals, locals u organitzatives. Aquests conceptes
addicionals seran tractats com extensions de l‟edició catalana.
2.2.4. Altres extensions. Permetre als usuaris gestionar extensions locals.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Crear i mantenir noves extensions d‟àmbit local
Descripció: El SIAP haurà de deixar crear noves extensions d‟àmbit local, així com la seva
edició, modificació i navegació, utilitzen sempre les directrius de la documentació oficial de
SNOMED CT.
2.2.5. Actualització dels subconjunts, extensions.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El SIAP ha de poder disposar d‟eines per l‟actualització dels subconjunts i
extensions de snomed CT
Descripció: El sistema ha de permetre actualitzar d‟una manera senzilla els repositoris
SNOMED CT, tant importar/exportar subconjunts i extensions com l‟actualització de termes
que passen de ser una extensió al catàleg oficial (nucli)
2.2.5.1. Importació d’arxius de distribució
Rang de prioritat: OPC
Objectiu: Importar els arxius amb les diferents versions de SNOMED CT.
Descripció: Els SIAPs haurien de ser capaços d‟ importar els arxius de distribució de SNOMED CT en el format intern utilitzat per a el recurs de SNOMED CT.
El procés d‟importació hauria de ser automatitzat i requerir la intervenció de l‟usuari només
per a la selecció de subconjunts, opcions de configuració o ambdós.
El procés d‟importació hauria d‟importar:
Els arxius principals (conceptes, descripcions i relacions). Un grup seleccionat de subconjunts Aquesta importació pot ser de:
un grup seleccionat d‟arxius de definicions de subconjunts files seleccionades a la Taula de Subconjunts i la Taula de Membres d‟un Subconjunt
Alguns subconjunts es poden utilitzar per a filtrar la importació d‟altres arxius de distribució. Les descripcions es poden filtrar per limitar la cobertura d‟un idioma o dialecte específic. Els conceptes es poden filtrar per limitar la cobertura als conceptes rellevants per a la medicina humana i excloure aquells rellevants per a la medicina veterinària.
10 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Les relacions associades amb qualsevol concepte que siguin excloses pel filtre de subconjunts també han de filtrar-se. Un subconjunt d‟idiomes pot alterar els valors del DescriptionType i/o del LanguageCode a la Taula de Descripcions distribuïda. Altres arxius de distribució necessaris pel conjunt de serveis requerits.
Verificació durant el procés d‟importació
El procés d‟importació hauria de verificar les dades importades per confirmar que:
Els arxius de distribució hagin importat totes les parts de la mateixa publicació. Tots els SCTID tinguin:
Un identificador de partició apropiat pel camp. Un dígit de control vàlid.
Es poden realitzar altres verificacions de coherència per assegurar la integritat de les dades.
2.2.5.2. Processament previ dels arxius de distribució realitzat pels proveïdors de SIAPs.
Rang de prioritat: OPC
Objectiu: Pre- processament dels arxius per agilitzar l‟accés.
Descripció: El procés d‟importació pot portar molt de temps degut a la necessitat de
construir índexs o altres estructures de dades. També pot ser necessari prescindir d‟una
capacitat d‟emmagatzematge substancial pels arxius temporals. Per tant, el proveïdor d‟un
SIAP pot optar per pre-importar els arxius de distribució i proveir als usuaris en forma pre-
processada. Malgrat això, l‟aplicació d‟importació també hauria d‟estar disponible en un
format segur per a les organitzacions usuàries finals, per a habilitar la instal·lació i el
manteniment de les extensions.
2.2.6. Importació de publicacions noves i d’actualitzacions
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El SIAP ha de permetre importar noves versions i/o actualitzar les existents.
Descripció: El SIAP ha de disposar de les funcionalitats necessàries per a importar noves
versions de snomed CT i actualitzar les existents, mantenint la coherència de l‟històric.
2.2.7. Importació d’extensions
Rang de prioritat: OPC
Objectiu: Permetre importar les extensions mitjançant SIAPs.
Descripció: Els SIAPs haurien de ser capaços d‟importar extensions. El procés d‟importació
d‟una extensió és similar a la importació dels arxius de distribució principals. Malgrat això, es
requereixen algunes funcionalitats addicionals per assegurar la instal·lació, el manteniment i
la utilització apropiades de les extensions.
11 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
2.2.8. Accés a la informació històrica
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Permetre l‟accés a la informació que del catàleg que ha patit canvis.
Descripció: Quan s‟instal·la una nova versió de publicació es requereix una aplicació que
permet actualitzar registres, índexs, cerques o protocols per a registrar los canvis en la
terminologia.
Per permetre aquestes activitats de manteniment, un SIAP hauria de proveir accés a:
La informació a la Taula d‟Història dels Components que indica quin components s‟han modificat des de la publicació anterior. La informació a la Taula de Referències (us futur) que identifica els components que substitueixen o que han estat duplicats per components inactius. Això no s‟aplica als conceptes (veieu la següent vinyeta) La informació a la Taula de Relacions que identifica aquells conceptes que: Substitueixen un concepte “erroni” RelationshipType “SUSTITUIT PER” Son idèntics a un concepte “duplicat” RelationshipType “IGUAL QUE” Són significats potencials d‟un concepte “ambigu” RelationshipType “POT SER UN” Prèviament eren subtipus d‟un concepte inactiu RelationshipType “HA ESTAT UN” (Us futur)
L‟accés a la Taula d‟Història dels Components i a la Taula de Referències (us futur) es
podria requerir només per donar suport durant un temps a un grup limitat d‟activitats de
manteniment després de cada publicació. Malgrat això, l‟accés a la informació respecte dels
conceptes actius relacionats amb els conceptes inactius sovint és necessari per a l‟operació
quotidiana de les aplicacions. Per exemple, afectarà a la recuperació selectiva i l‟anàlisi de la
informació de dades originalment registrades amb un concepte que ara es troba inactiu.
2.2.8.1. Permetre la cerca de qualsevol terme SNOMED CT ja sigui pel seu codi o descripció (FSN, favorit, sinònims) o per qualsevol combinació de subconjunts i extensions definides al SIAP.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Definir les possibilitats del navegador per a la localització d‟un terme de SNOMED
CT.
Descripció: La implementació efectiva de SNOMED CT depèn de la rapidesa i la simplicitat
amb la que els usuaris puguin localitzar els termes i conceptes que desitgin utilitzar. Un
metge ocupat pot sentir-se frustrat si el contingut que necessita no es pot localitzar
ràpidament quan realitza una cerca utilitzant paraules o frases conegudes. Per aquesta raó,
una estratègia de cerca eficient hauria de tenir en compte els següents aspectes:
Velocitat de cerca La velocitat de la cerca s‟hauria d‟optimitzar mitjançant la utilització d‟índexs apropiats
12 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
La cerca no hauria de ser massa sensible a l‟ordre de paraules o a la exactitud de les frases La cerca hauria de ser insensible a les variants d‟ordre o de paraules Per exemple, ”mal de cap” por ”mal al cap” Permetre l‟ utilització de sigles i abreviatures pels termes utilitzats freqüentment Per exemple, ”IM” per a ”infart de miocardi” o ”insuficiència de la vàlvula mitral” La cerca hauria de registrar les variants morfològiques Per exemple, ”inflamat”, ”inflamatori”, ”inflamació” Els resultats de cerca excessius no haurien d‟impedir la selecció del concepte requerit Quan varis sinònims d‟un mateix concepte coincideixen amb el resultat de la cerca, se n‟hauria de mostrar només un .
L‟objectiu d‟aquesta secció de la guia d‟implementació és descriure estratègies que un
desenvolupador pot utilitzar per implementar els requeriments de cerca abans mencionats.
2.2.9. Mostrar informació detallada de la procedència o pertinència del terme referit envers extensions i subconjunts en els que estigui referenciat.
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El navegador de SNOMED CT proporcionarà la informació de procedència del
terme buscat.
Descripció: Quan el navegador torni el terme sol·licitat, aquest haurà de proporcionar tota la
informació relacionada amb la procedència i subconjunts amb els que pugui estar relacionat.
2.2.10. Indicar les relacions que te el terme trobat amb altres termes i permetre navegar per ells.
Rang de prioritat: OPC
Objectiu: Possibilitar la visualització i navegació mitjançant els termes relacionats.
Descripció: Les relacions connecten els conceptes a SNOMED CT. Existeixen quatre tipus
de relacions:
Definitòries Qualificadores Històriques Addicionals
En aquesta secció es consideren les relacions conegudes com "definitòries," que s‟utilitzen
per modelar conceptes i crear les seves definicions lògiques.
2.3. Accés segur i confidencialitat de les dades
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: Garantir la confidencialitat de les dades emmagatzemades i garantir el secret en
les comunicacions.
13 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Descripció: Haurà de complir amb les lleis vigents en l‟estat espanyol, així com les
regionals o particulars. Actualment es regeix sota la Llei Orgànica 15/1999, del 13 de
desembre, de Protecció de Dades de Caràcter Personal, (LOPD
D‟antre aquestes característiques, haurà de controlar l‟accés de personal no autoritzat a
funcions de manteniment o gestió.
Exemples: Xifratge de les dades sensibles segons la llei, controlar l‟accés a la aplicació,
registre d‟activitats d‟accés als fitxers marcats per la llei, xifrar les comunicacions, etc.
2.4. Integració amb sistemes
Rang de prioritat: OBL
Objectiu: El SIAP ha de ser capaç de publicar els informes d‟anatomia patològica per a
l‟ Història clínica compartida de Catalunya.
Descripció: Tot SIAP ha de poder exportar els informes d‟anatomia patològica en el
missatge de finalització per la història clínica compartida de Catalunya.
2.5. SCTID.
Aquesta secció descriu les característiques de tots els camps amb el tipus de dada SCTID.
Aquests identificadors comparteixen un grup de característiques i obeeixen a certes regles,
que disposen que cada identificador es refereixi de manera unívoca a un únic component.
2.5.1. El Tipus de dades SCTID
El SCTID és un número enter de 64 bits, subjecte a les següents restriccions:
Només es permeten valors enters positius. El valor mínim permès és 100.000 (6 dígits) El valor màxim permès és 999.999.999.999.999.999 (18 dígits). Com resultat de certes regles aplicables als identificadors de partició i als dígits de control, molts números enters dins del rang mencionat no constitueixen SCTID vàlids.
2.5.2. Representació del SCTID
El SCTID no conté informació semàntica relacionada amb el significat d‟un concepte o
terme. Malgrat això, posseeix una estructura dissenyada per permetre el reconeixement de
diferents tipus de components terminològics. La naturalesa d‟un component pot derivar
també de la taula en la qual es distribueix. L‟avantatge de partir el SCTID és que evita la
reutilització del mateix identificador per a un altre tipus de component i la consegüent
ambigüitat. Tanmateix, permet reconèixer la naturalesa de l‟identificador fins i tot en altres
contextos, com un registre o un missatge.
14 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Fig. Estructura del SCTID per un component originat en SNOMED CT.
Els dígits en una cadena de decimals que conformen el SCTID posseeixen els següents rols
definits (veure Figura):
Un únic dígit de control utilitzat per validar l‟identificador. Un identificador de partició de dos dígits, que: Asseguri que l‟identificador sigui únic en el camp de SNOMED CT. Per exemple, no és possible destinar el mateix identificador a un concepte i a una descripció. Asseguri que l‟identificador d‟un component en una extensió de SNOMED CT vàlida no sigui el mateix que el d‟un component que pertany al nucli de la terminologia.
2.5.3. El SCTID i les extensions
Si l‟identificador de partició indica que el SCTID forma part d‟una extensió, els següents set
dígits (a partir de la dreta) seran l‟ identificador de l‟espai de noms (veure Figura 7). els
identificadors de l‟espai de noms son destinats a organitzacions autoritzades a emetre
extensions. Assegurant que cada organització crea SCTID únics, al mateix temps que
permeten guardar registre de l‟origen de cada identificador.
15 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Fig. Estructura del SCTID pel component d‟una Extensió.
2.5.4. Restriccions dels SCTID
Les restriccions al rang de valors possibles pel SCTID permeten la representació coherent
d‟aquests valors mitjançant nombres enters i cadenes.
L‟exclusió de valors negatius evita la possible confusió al format de les representacions de
cadenes.
El límit inferior de 100.000 assegura que la representació en decimals arribi a una extensió
d‟ almenys sis dígits. Això assegura la possibilitat de poder diferenciar un SCTID de:
Un Codi Read, que conté 4 o 5 caràcters d‟extensió. Un identificador de SNOMED (SNOMED ID), que comença sempre amb una lletra.
El límit superior de 18 dígits assegura que qualsevol cadena de decimals vàlida pugui ser
emmagatzemada com un nombre enter de 64 bits.
2.5.5. Dígit de control
L‟últim dígit del SCTID és el dígit de control.
No es prevéu que els usuaris tinguin que introduir els valors del SCTID com a pràctica de
rutina. En canvi, l‟objectiu del dígit de control és detectar els tipus més comuns d‟ errors,
como els tipogràfics, en aquelles ocasions en les que els mecanismes de transcripció o
comunicació portin a equivocacions, com per exemple, certes activitats de desenvolupament
avançades que involucren la creació o modificació de protocols o de cerques
preespecificades.
Mitjançant el “dígit de Verhoeff”, un codi díedre D5, és possible verificar el SCTID i detectar
una major proporció d‟errors tipogràfics comuns que amb el mètode Modulus 11 o el dígit
IBM. Contràriament al que passa amb el dígit de Modulus 11 (utilitzat pel NHS al Regne
Unit), el mètode de Verhoeff és efectiu amb cadenes de decimals de més de deu dígits. A
més, es pot representar com un dígit decimal, sense excloure cap valor.
16 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Veure l‟Apèndix F per major informació sobre el dígit de control de Verhoeff i un exemple de
codificació segons aquest mètode.
2.5.6. Identificador de partició
El segon i tercer dígit del SCTID, començant des de la dreta, conformen l‟identificador de
partició.
Aquest identificador indica la naturalesa de l‟entitat identificada. Això permet diferenciar
l‟identificador d‟una descripció d‟aquell d‟un concepte, així com els SCTID dels components
de SNOMED CT amb respecte als components de les extensions.
El valor de l‟identificador de partició dels components de SNOMED CT correspon a un dels
següents:
00 Un concepte
01 Una descripció
02 Una relació
03 Un subconjunt
04 Un conjunt de referències creuades
05 Una referència creuada de destí
El valor de l‟identificador de partició dels components d‟una extensió correspon a un dels
següents:
10 Un concepte en una extensió
11 Una descripció en una extensió
12 Una relació en una extensió
13 Un subconjunt en una extensió
14 Un conjunt de referències creuades en una extensió
15 Una referència creuada de destí en una extensió
Tots els altres valors per l‟identificador de partició es reserven per utilització futura.
2.5.7. Espais de noms d’una extensió
Si l‟identificador de partició indica que el SCTID és part d‟una extensió, els dígits a l‟esquerra
del dígit de partició conformen l‟identificador de l‟espai de noms.
17 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
A cada organització autoritzada a crear extensions se li assigna un identificador de domini i
se li permet crear identificadors que finalitzin amb aquesta cadena de dígits.
Els arxius de publicació del nucli de SNOMED CT inclouen conceptes de domini, que
representen a cadascun dels identificadors de l‟espai de noms assignats. Aquests conceptes
posseeixen les següents característiques:
Són subtipus directes del concepte “Concepte d‟ espai de noms” que, a la vegada, és subtipus directe de “Concepte especial” La descripció completa (Fully Specified Name) te la forma “Espai de Noms de l‟Extensió {nnnnnnn} (concepte d‟espai de noms) – en la que nnnnnnn representa els set dígits de l‟identificador de l‟espai de noms. El terme preferit associat amb el concepte te la forma “Espai de Noms de l‟Extensió nnnnnnn” En els casos en que existeixen sinònims, es poden incloure per tal d‟identificar la naturalesa de l‟extensió i/o la organització responsable. En canvi, aquesta informació no està disponible per a tots els espais de noms, degut a restriccions de privacitat.
2.5.8. Dígits de l’identificador de cada entitat
els altres dígits a l‟esquerra de l‟identificador de partició (o en el cas de les extensions, a
l‟esquerra de l‟identificador de l‟espai de noms) identifiquen cada entitat individual dins de la
partició especificada. El mateix identificador d‟entitat pot ser assignat a cada partició.
L‟identificador de partició assegura que cadascun d‟aquests identificadors siguin únics.
En el cas dels components de SNOMED CT, els identificadors de cada entitat solen ser
assignats en l‟ordre arbitrari en el que s‟agreguen els components a SNOMED Clinical
Terms. Per aspectes inherents al procés d‟edició, la seqüència dels identificadors de les
entitats generades pot ser discontinua, pel que l‟ordre dels identificadors no te cap significat.
2.5.9. SCTID - Exemples
Els següents exemples de SCTID es basen en les regles escrites a les seccions anteriors i
il·lustren el rang d‟identificadors d‟entitats possibles a cada partició.
SCTID Identificador de
partició
Díg.
Control
Notes
100005 00=Concepte 5=OK els dígits d‟identificació d‟entitats „1000‟
són els valores mínims permesos; així
aquest es el SCTID mínim que pot ser
assignat a un concepte.
100014 01=Descripció 4=OK Aquest es el SCTID mínim que pot ser
assignat a una descripció.
100022 02=Relació 2=OK Aquest es el SCTID mínim que pot ser
assignat a una relació.
100033 03=Subconjunt 3=OK Aquest es el SCTID mínim que pot ser
assignat a un subconjunt.
18 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
101291009 00=Concepte 9=OK Un SCTID vàlid per un concepte.
1290023401015 01=Descripció 5=OK Un SCTID vàlid per una descripció.
9940000001029 02=Relació 9=OK Un SCTID vàlid per una relació.
40099901037 03=Subconjunt 7=OK Un SCTID vàlid per un subconjunt.
10000001105 10=Concepte
extra
5=OK Un SCTID vàlid per a un concepte en
una extensió en l‟espai de noms
0000001.
10989121108 10=Concepte
extra
8=OK Un SCTID vàlid per a un concepte en
una extensió en l‟espai de noms
0989121.
1290989121103 10=Concepte
extra
3=OK Un SCTID vàlid per a un concepte en
una extensió en l‟espai de noms
0989121.
1290000001117 11=Descripció
extra
7=OK Un SCTID vàlid per a una descripció en
una extensió en l‟espai de noms
0000001.
9940000001126 12=Relació extra 6=OK Un SCTID vàlid per a una relació en
una extensió en l‟espai de noms
0000001.
40000001132 13=Subconjunt
extra
2=OK Un SCTID vàlid per a un subconjunt en
una extensió en l‟espai de noms
0000001.
999999990989121104 El SCTID màxim vàlid per un concepte
en una extensió en l‟espai de noms
0989121.
2.6. Mitjans de distribució
Un centre nacional membre de la IHTSDO distribueix l‟Edició Internacional de SNOMED CT.
els arxius del nucli de la terminologia es troben en l‟estructura estàndard d‟arxius plans per a
les terminologies d‟atenció de la salut. Veure l‟arxiu readme.txt per a obtenir una llista
completa dels arxius inclosos a la publicació. Aquests arxius es poden carregar en l‟arxiu o
sistema de base de dades específic de cada usuari.
2.7. Formats d’arxiu
Els arxius de SNOMED CT es codifiquen en format UTF-8, per permetre grups de caràcters
de tot el mon. Alguns productes de base de dades, com Oracle, requereixen l‟especificació
19 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
d‟UTF-8, sense la qual poden sorgir dificultats per a utilitzar caràcters especials. És
important saber que aquests caràcters especials apareixen ocasionalment tant a l‟edició
anglesa de SNOMED CT, com a les edicions en altres idiomes, inclòs en termes mèdics
que inclouen epònims.
Els arxius de publicació de SNOMED CT es denominen d‟acord amb la següent convenció:
sct_filename_yyyymmdd.tx yyyymmdd (any, mes, dia) representa la data de publicació en format ISO.
Per exemple, la primera publicació de SNOMED CT (31 de gener de 2002) conté arxius
denominats
sct_concepts_20020131.txt sct_descriptions_20020131.txt sct_relationships_20020131.txt
Amb cada publicació es distribueix un arxiu readme.txt, que conté la llista completa d‟arxius i
les seves dimensiones.
2.7.1. Estructura dels directoris i convencions de denominació
Cadascun dels arxius comprimits que es distribueixen poden contendre varis arxius i
subdirectoris, que es denominen de manera de reflectir el tipus de material que contenen, la
versió en format yyyymmdd (any, mes, dia) i la extensió d‟arxius “.zip”. Per exemple:
SNOMED_CT_International_Release_20070731_essential.zip conté els següents arxius i subdirectoris: Contingut sct_concepts_20070731.txt sct_descriptions_20070731.txt sct_relationships_20070731.txt Referències Creuades sct_crossmapsets_icdo_20070731.txt sct_crossmaptargets_icdo_20070731.txt sct_crossmaps_icdo_20070731.txt Historial sct_componenthistory_.txt 20070731.txt Subconjunts sct_subsetmembers_us_20070731.txt sct_subsets_us_20070731.txt.txt sct_subsetmembers_uk_20070731.txt sct_subsets_uk_20070731.txt sct_subsetmembers_vtm_vmp_20070731.txt sct_subsets_vtm_vmp_20070731.txt sct_subsetmembers_doseform_20070731.txt sct_subsets_doseform_20070731.txt
En el cas dels arxius descomprimits, s‟utilitzen directoris similars.
20 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
2.7.2. Informació sobre la versió de la terminologia
El terme d‟ una descripció del concepte arrel conté informació sobre la publicació actual. La descripció que conté aquesta informació es un sinònim (Descriptiontype=2) i el seu estat és actiu (DescriptionStatus=0). La descripció que conté la informació de versió de cada publicació te un. DescriptionId únic (p.e. no és una revisió de la versió anterior de la descripció). En cada publicació existeix un únic terme preferit i una “versió” activa del sinònim associat amb el concepte arrel. Els sinònims de versions anteriors, ara inactius, tenen el DescriptionStatus=1. La informació en el sinònim d‟una versió donada es representa en el camp del terme, de la següent manera: Versió de SNOMED Clinical Terms: yyyymmdd (any, mes, dia) [estat] (descripció) estat representa una paraula que indica si es tracta d‟una publicació [R (Release)] o si pertany a un altre estat (p.e. grup de desenvolupament [D], evaluació [E], etc). yyyymmdd (any, mes, dia) representa la data de publicació en format ISO. descripció és un camp que inclou un text descriptiu sobre la publicació (opcional).
Per exemple: SNOMED CT 20020131 [R]
Pot haver-hi altres sinònims actius per al concepte arrel.
Les aplicacions preparades per a SNOMED CT han d‟assegurar que aquesta informació
sigui visible, juntament amb la declaració de propietat intel·lectual i altre informació similar
sobre la terminologia.
Codificació amb Unicode UTF-8
UTF-8 és una codificació eficient de cadenes amb caràcters Unicode, que reconeix el fet de
que la majoria de les comunicacions basades en text utilitzen el codi ASCII i optimitza així la
codificació d‟aquests caràcters. Moltes aplicacions de 32 bits de Windows™ possibiliten l‟ús
d‟UTF-8.
Es prefereix Unicode a ASCII perquè permet la inclusió d‟accents, símbols científics i
caràcters propis d‟altres idiomes, a més de l‟anglès. Aquest format constitueix el mecanisme
estàndard més eficient per codificar caràcters Unicode de 16 bits en aquells casos en els
que la majoria dels caràcters pertanyen al codi ASCII. Els sistemes operatius moderns de 32
bits como Windows™ 95, 98 i NT permeten la codificació mitjançant UTF-8 o UTF-16.
SNOMED CT utilitza caràcters en UTF-8.
2.7.3. Càlcul del dígit de control
Dígit de control de Verhoeff
El dígit de control de Verhoeff reconeix tots els errors simples, totes les transposicions
adjacents, més del 95% dels errors dobles, més del 94% de les transposicions de dígits
discontinus i d‟errors dobles en dígits discontinus, així como la majoria dels errors fonètics.
Per tant, i al igual que Modulus 11, el dígit de Verhoeff redueix el nombre d‟errors no
detectats a un 2 o 3%. La diferència amb Modulus 11 és que utilitza un dígit de control
decimal i no limita el rang de números vàlids.
21 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
La majoria dels errors no detectats amb Modulus 11 i amb el dígit control de Verhoeff
provenen d‟agregats o omissions de dígits. Qualsevol dels mètodes de dígits de control no
reconeix el 10% d‟aquests errors, que varien entre 10% i 20%. L‟esquema de Verhoeff no
reconeix quatre errors dobles en dígits discontinus amb una diferencia de 5 (p.e. 050 vs.
505, 161 vs. 616, 272 vs. 727, i 494 vs. 949).
Càlcul del dígit de control de Verhoeff pel mètode dels díedres D5
La descripció matemàtica d‟aquesta tècnica pot semblar complexa, però en la pràctica pot
reduir-se a un parell de vectors bidimensionals, un vector invers unidimensional i un
procediment computacional simple. Aquests tres vectors es mostren en la Figura 8.
El primer vector conté el resultat de la multiplicació de “Díedres D5”. El segon vector consisteix en 8 files de les quals dues es defineixen, mentre que la resta es deriva aplicant la següent fórmula: F(i, j) = F(i - 1, F(1, j)). El tercer vector consisteix en una sola fila que conté la versió inversa de la ordenació de díedres D5. Identifica la localització de tots els valores cero en el primer vector.
els vectors utilitzats en el càlcul del dígit de control de Verhoeff
L‟identificador es controla començant pel dígit a l‟extrem dret (el dígit de control mateix) i
processant cada dígit cap a l‟esquerra de la següent manera:
Check = ArrayDihedralD5 (Check, ArrayFunciónF((Position Modulus 8), Digit))
Check = el valor corrent del valor numèric (comença en zero i es modifica en cada etapa).
Position = la posició del dígit (des de la dreta, començant en zero).
Digit = el valor del dígit.
El valor final del Check hauria de ser zero. Si no, el procés de control haurà fallat.
Per calcular el dígit de control s‟aplica el mateix procés amb una variació mínima:
Position és la posició que adoptarà el dígit un cop s‟hagi agregat el dígit de control.
22 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
El valor final del Check s‟aplica a la ordenació D5 inversa per trobar el dígit de control correcte.
Check-digit = ArrayInverseD5(Check).
2.8. Descripció completa (Fully Specified Name, FSN)
Cada concepte te una descripció completa (FSN) que constitueix una forma no ambigua de
nombrar a un concepte. El propòsit del FSN és identificar de manera unívoca un concepte i
aclarir el seu significat; no necessariament representa la frase més utilitzada o natural per
descriure aquell concepte. Cada FSN finalitza amb un identificador ("semantic tag") que
remet a la categoria semàntica a la que pertany el concepte (per exemple: trastorn,
organisme, persona, etc.). Per exemple, Hematoma (anomalia morfològica) es un FSN que
representa la descripció del que l‟anatomopatòleg observa a nivell tissular, mentre que
Hematoma (trastorn) és un FSN que indica el concepte que hauria d‟utilitzar un metge
general per codificar el diagnòstic clínic d‟un hematoma.
2.9. Terme preferit
Cada concepte te un terme preferit (Preferred term) que representa la paraula o frase més
comú utilitzada per descriure-ho. Per exemple, el concepte 177594004 Perforació de lòbul
de l‟orella per inserir arracades, anelles o d‟altres ornaments (procediment) te el terme
preferit "Pírcing del lòbul de l‟orella" per representar el nom més comú que el metge utilitza
per a descriure aquest procediment.
A diferencia dels FSN, els termes preferits no necessariament són únics. Ocasionalment, el
terme preferit per a un concepte també pot ser el sinònim o el terme preferit d‟un altre
concepte.
2.10. Sinònims
Els sinònims representen altres termes utilitzats per descriure el mateix concepte que el
FSN. Com s‟ha explicat pels termes preferits, els sinònims no necessariament són únics per
a cada concepte.
El mecanisme de les extensions és una estructura que habilita a organitzacions autoritzades
a agregar conceptes, descripcions, relacions i subconjunts per a complementar el contingut
del nucli de la terminologia de SNOMED CT - Edició Internacional. Un exemple del
mecanisme d‟extensió és l‟extensibilitat de SNOMED CT per a les necessitats
terminològiques especialitzades d‟una organització.
Els objectius de les extensions són els següents:
Brindar una estructura on aquestes extensions mantinguin una mateixa identificació entre organitzacions per a transmetre i compartir dades, però que a la vegada comparteixen una estructura comú per a facilitar el desenvolupament de l‟aplicació, de manera tal que sigui possible construir subconjunts sobre una combinació de contingut de l‟Edició Internacional de la terminologia i de l‟extensió.
23 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Definir una estructura que faciliti l‟enviament, la inclusió, la utilització i la migració de terminologia creada como part d‟ una extensió al contingut de la Edició Internacional.
Quan el contingut d‟una extensió es superposa amb l‟abast de SNOMED CT, ha d‟enviar-se
per a la consideració del Centro Nacional local de la IHTSDO, de manera que altres usuaris
de SNOMED CT també puguin beneficiar-se amb aquell treball. L‟estructura de les
extensions també pot ser útil per a que les organitzacions transfereixin la responsabilitat per
la terminologia a la IHTSDO o a altres organitzacions que depenguin dels termes de la
Llicencia d‟Afiliació.
2.11. Definicions de relacions i conceptes
Cada concepte de SNOMED CT es defineix lògicament mitjançant les seves relacions amb
altres conceptes.
Cada concepte actiu de SNOMED CT (excepte el concepte arrel "Concepte de SNOMED
CT") te al menys una relació IS_A (ES UN/UNA) amb un supertipus o concepte pare.
Les relacions IS_A (Es UN/UNA) i les relacions d‟ atributs son les "característiques
definidores" dels conceptes de SNOMED CT. Es consideren definidores per que s‟utilitzen
per a representar lògicament un concepte mitjançant l‟ establiment de les seves relacions
amb altres conceptes. Això s‟aconsegueix amb la creació de relacions IS_A (ES UN/UNA)
amb un o més conceptes definitoris (anomenats supertipus) i el modelat de les diferencies
amb aquells supertipus mitjançant els atributs definitoris.
Només es pot assignar una relació quan sigui sempre vertadera. Per exemple, el
Streptococcus del Grup A és la causa de la majoria dels casos de faringitis estreptocòccia.
No obstant, altres especies de Streptococcus causen un petit percentatge d‟aquests casos.
En conseqüència, al definir el concepte Faringitis estreptocòccia (trastorn), no es selecciona
al Streptococcus del Grup A com valor per l‟atribut AGENT CAUSAL, sinó que s‟utilitza un
concepte mes general, Streptococcus (organisme).
2.11.1. Relacions IS_A (ES UN/UNA)
Les relacions IS_A (ES UN/UNA) també es denominen "relacions de supertipus-subtipus" o
"relacions pare-fill." Les relacions IS_A (ES UN/UNA) són la base de les jerarquies de
SNOMED CT.
Un concepte pot tenir més d‟una relació IS_A (ES UN/UNA) amb altre conceptes. En aquell
cas, el concepte tindrà conceptes pares en més d‟ una subjerarquia d‟una jerarquia de nivell
superior. Les relacions de subtipus poden ser multi jeràrquiques.
2.11.2. Relacions d’ atributs
Els atributs relacionen dos conceptes entre sí i estableixen el tipus de relació entre ells.
Juntament amb les relacions IS_A (ES UN/UNA) es consideren característiques definidores
per que permeten la representació lògica del significat d‟un concepte mitjançant la creació
de relacions amb altres conceptes. La definició lògica d‟un concepte inclou un o més
24 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
supertipus (modelats amb relacions IS_A (ES UN/UNA)) i un conjunt d‟atributs definitoris que
representen el significat d‟un concepte i ajuden a diferenciar-los d‟altres definicions de
conceptes, inclosos els seus supertipus.
En l‟exemple que es presenta a continuació, Discitis lumbar (trastorn) (un concepte de la
jerarquia Hallazgo clínico) es relaciona amb conceptes de la jerarquia Estructura corporal
mitjançant dos atributs: SITIO DEL HALLAZGO (FINDING SITE) i MORFOLOGÍA
ASOCIADA (ASSOCIATED MORPHOLOGY).
Exemples:
Fractura de l‟os del tars (trastorn)
IS_A (ES UN/UNA) Fractura del peu (trastorn)
FINDING SITE (SITIO DEL HALLAZGO) Estructura òssia del tars (estructura corporal)
ASSOCIATED MORPHOLOGY (MORFOLOGÍA ASOCIADA) Fractura (anomalia
morfològica)
Trastorn del peu (trastorn) IS_A (ES UN/UNA) Lesió traumàtica del peu (trastorn) IS_A (ES UN/UNA) Fractura del peu (trastorn) IS_A (ES UN/UNA)
Fractura exposada del peu (trastorn)
Fig. Relacions IS_A (ES UN/UNA)
Discitis lumbar (trastorn)
SITIO DEL HALLAZGO (FINDING SITE) Estructura de disc intervertebral lumbar (estructura
corporal)
MORFOLOGÍA ASOCIADA (ASSOCIATED MORPHOLOGY) Inflamació (anomalia
morfològica)
Ambdós atributs SITIO DEL HALLAZGO (FINDING SITE) i MORFOLOGÍA ASOCIADA
(ASSOCIATED MORPHOLOGY) i els seus valors assignats defineixen el concepte Discitis
lumbar (trastorn).
Part de la definició lògica (una llista de relacions entre conceptes) del concepte Pneumònia
(trastorn) en SNOMED CT eé:
25 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Pneumònia (trastorn)
SITIO DEL HALLAZGO (FINDING SITE) Estructura del pulmó (estructura corporal)
En aquest exemple, el concepte Pneumònia (trastorn) s‟ha caracteritzat amb l‟atribut SITIO
DEL HALLAZGO. Com la pneumònia és un trastorn del pulmó, el SITIO DEL HALLAZGO te
el valor Estructura del pulmó (estructura corporal).
Al treball diari de cada cas d‟estudi dins del SIAP, aquest ha de permetre la recerca de
SNOMED CT mitjançant el navegador de SNOMED amb tota la potencia que permet el
disposar de les eines anteriorment nombrades podent, dins del buscador de SNOMED CT,
fer recerques per extensions o subconjunts concrets, per el nucli, o en un idioma concret
(idioma per defecte nucli SNOMED CT / idioma català mitjançant el subconjunt català que
es defineixi), etc.
2.12. Importació: Formats de publicació actualitzats
Cada publicació del contingut central de SNOMED CT serà distribuïda en forma completa i
no com un conjunt de canvis i agregats. En canvi, es proveeix informació històrica sobre
publicacions anteriors. L‟estructura dels arxius històrics es descriu al detall en la Guía de
Referència Técnica. Altres opcions futures podrien incorporar la distribució d‟arxius de
conjunts de canvis que inclouran les modificacions entre les versions, a més de la publicació
completa. Aquesta forma de distribució també pot ser apropiada per a agregats entre
versions, per a cobrir els nous conceptes sol·licitats. En aquesta etapa no hi ha
especificacions detallades per a aquests tipus d‟ actualitzacions. En canvi, s‟està avaluant
l‟inclusió d‟una representació en XML centrada en el concepte.
2.13. Actualització a partir dels arxius de distribució
El procés d‟actualització d‟un SIAP a partir d‟una nova publicació dels arxius de distribució
és similar al de la importació original. En canvi, el procés d‟importació hauria de permetre la
retenció i/o la reinstal·lació de les configuracions locals tales como les extensions
instal·lades i els subconjunts seleccionats.
Una alternativa de la repetició del procés d‟importació és llegir i aplicar els canvis indicats a
la Taula de Historia de los Componentes. Els arxius de distribució són encara necessaris
com l‟ origen dels components addicionals que s‟han agregat entre publicacions. A més, la
Taula de Historia dels Componentes només indica els canvis realitzats als conceptes i les
descripcions. No obstant, estan en discussió els canvis al format de distribució per a
permetre una millor representació de tots els canvis als components de SNOMED CT.
Aquest procés es descriu de la següent manera:
Llegir la Taula de Historia dels Componentes Identificar tots els canvis des de l‟última publicació utilitzats per actualitzar el SIAP. Per cadascun d‟aquests canvis, verificar el valor del ChangeType (Tipus de Canvi). Si el ChangeType és igual a 1 (canvi d‟estat), aplicar el nou estat al component en el recurs del SIAP.
26 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Per exemple, si el nou estat d‟un concepte es Duplicat, aquest estat s‟aplica al concepte identificat. Per a molts conceptes no activats, es pot utilitzar l‟arxiu de relacions per a identificar un concepte inactiu que serà candidat a ser utilitzat en lloc del concepte no activat. Si el ChangeType és igual a 0 (agregat), buscar el component rellevant en els arxius de distribució i agregar-lo al recurs del SIAP. Si el ChangeType és igual a 2 (canvi menor), buscar el component rellevant als arxius de distribució i aplicar les noves dades al component en el recurs del SIAP.
Aquest enfocament és més complex que importar la nova publicació. En canvi, pot facilitar la
retenció de les dades de configuració local (per exemple, subconjunts seleccionats i
qualsevol extensió prèviament instal·lada).
Si el proveïdor del SIAP preimporta les publicacions de SNOMED CT per a distribuir als
seus usuaris, aquest abordatge facilita la producció d‟actualitzacions redistribuïbles.
2.14. Importació d’extensions
Les aplicacions haurien de:
Permetre als usuaris o comunitats d‟usuaris especificar les extensions que haurien de reconèixer els seus sistemes. Abans de reconèixer qualsevol extensió els usuaris haurien de verificar que: L‟extensió hagi sigut prevista per la IHTSDO o una altre organització autoritzada per aquesta per a proveir tals extensions. El client estigui conforme amb els procediments de control de qualitat de l‟organització proveïdora. La autorització d‟una organització per a produir extensions no constitueix una garantía de la qualitat de les extensions proporcionades per aquelles organitzacions. La instal·lació de les extensions es realitza completament sota el risc de l‟usuari, subjecte al acord de les llicencies amb el proveïdor de la extensió i/o amb el desenvolupador de l‟ aplicació. Verificar cada extensió antes de la instal·lació per a assegurar que: Sigui una de les extensions reconegudes per l‟usuari. S‟hagin complert les característiques de dependència de l‟extensió. Aquestes característiques de dependència poden incloure: Instal·lació d‟una publicació específica de SNOMED CT; Instal·lació prèvia d‟altres extensions. Que el procés d‟instal·lació hagi verificat prèviament tots els components en la extensió per a assegurar que: Tots els ComponentID: Siguin únics. Tinguin valors d‟identificador de partició i d‟ identificador d‟espai de noms apropiats per al proveïdor d‟aquella extensió. Tinguin un dígit de control vàlid. Que tots els camps tinguin el tipus de dades, la mida i les restriccions de valors especificats per a les taules pertinents.
Precaució:
Si qualsevol dels components no satisfà alguna d‟aquestes probes, l‟Extensió completa ha
de ser rebutjada.
27 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Importar els arxius d‟extensió de tal manera que reemplacin a les versions anteriors de la mateixa extensió i simultàniament enriqueixin, en lloc de reemplaçar, la distribució de SNOMED CT i altres extensions instal·lades. Rebutjar, ressaltar o aplicar altres regles de negocis acordades a la informació rebuda pel sistema que conté els SCTID per als components dels espais de noms que no estiguin a la llista o a les extensions reconegudes.
28 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
3. Glossari
Identificador de SNOMED Clinical Terms (SCTID): Els components dins de SNOMED
Clinical Terms es diferencien amb identificadors numèrics. A les descripcions de les taules
individuals aquests identificadors posseeixen el tipus de dada.
Rang de prioritat EN: Essencial Ara. Les funcions considerades més rellevants o
essencials per a la majoria d‟entorns sanitaris. Aquestes funcions han d‟estar incloses per a
ser considerat que compleix el criteri de conformitat
Rang de prioritat EF: Essencial en el futur. Les funcions considerades més rellevants o
essencials per a la majoria d‟entorns sanitaris, però que no són realitzables fins que
s‟acompleixin certes condicions específiques. Les condicions futures normalment es
descriuen en unitats de temps des de que el perfil ha estat publicat, en determinades
ocasions, les condicions futures també podrien dependre d‟esdeveniments com l‟adopció
d‟un estàndard específic.
Rang de Prioritat (O): Opcional. Son funcions considerades rellevants i possiblement
essencials per alguns però no per a tots els sistemes de les Autoritats Sanitàries. Les
funcions amb aquest rang de prioritat podrien estar presents dins del sistema però no són
essencials per acomplir el criteri de conformitat.
SIAP: Sistema d‟Informació d‟Anatomia Patològica.
SNOMED CT: SNOMED Clinical Terms ® és una terminologia mèdica integral que ofereix
contingut clínic i expressivitat per la documentació i comunicació mèdica. Es pot utilitzar per
codificar, recuperar i analitzar dades clíniques.
Subconjunt SNOMED CT: Els subconjunts representen grups de components que
comparteixen característiques específiques que afecten la forma en la que estan disposats o
son accessibles dins d‟un domini, una especialitat, una aplicació o un context en particular.
S‟utilitzen diferents tipus de subconjunts per representar:
Variants d‟idioma i dialecte, Freqüència d‟us de les descripcions o conceptes en dominis o especialitats en particular, Adaptabilitat de conceptes específics per a ser utilitzats en un context particular dins d‟un registre, Estructura i ordre de les jerarquies que exhibeixen els conceptes per a la navegació per part de l‟usuari.
Els subconjunts es publiquen en format relacional, com una fila a la Taula de Subconjunts i
un conjunt de files a la Taula de Membres d‟un Subconjunt. Les files a la Taula de Membres
d‟un Subconjunt contenen un identificador de subconjunt (SubsetID) comú que les associa
amb la fila apropiada a la Taula de Subconjunts.
Els subconjunts són una altra característica valuosa de SNOMED CT. Ofereixen informació
important per l‟ús i la implementació de la terminologia. La pertinència d‟un component de
SNOMED CT a un subconjunt en particular ofereix informació que excedeix a la del
component en sí mateix.
29 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
SNOMED CT és una terminologia extensa i els subconjunts poden definir porcions que
utilitzaran usuaris específics. Per exemple, un subconjunt de dialecte en anglès britànic pot
dirigir als usuaris a les descripcions dels termes del Regne Unit en comptes de remitir-los a
totes les descripcions en Anglès. Fixi‟s que depèn de l‟implementador l‟ús dinàmic o estàtic
d‟un subconjunt i si el seu contingut s‟utilitza en forma prioritària o exclusiva. Per més
informació, vegi la Guía d‟Implementació Tècnica de SNOMED CT.
En la seva forma més simple, el Mecanisme de Subconjunts és una llista d‟identificadors de
SNOMED (SCTID). Cada SCTID es refereix a un component de SNOMED CT, és a dir, un
membre del subconjunt (denominat un “Membre del subconjunt”). Com analogia, és útil
pensar en SNOMED CT com un llibre. Un subconjunt equival a una entrada de l‟índex que
assenyala un conjunt de pàgines envers un tema en particular.
Els subconjunts no necessariament s‟exclouen entre sí. El seu contingut es pot superposar.
Subconjunt SNOMED CT -> Taula de conceptes: Cada fila a la Taula de Conceptes
representa un concepte mèdic. Cada concepte te un identificador únic i una Descripció
Completa (Fully Specified Name) que especifica la naturalesa del concepte.
Camps Clau
ConceptId L‟ identificador únic de SNOMED Clinical Terms per aquest
concepte.
Camps de dades
ConceptStatus L‟estat d‟un concepte indica si es troba en us actiu i, pel contrari, la
raó per al seu retirament.
FullySpecifiedName Una frase única que descriu el concepte amb la finalitat de que no
sigui ambigu. La descripció completa també està present a la Taula
de Descripcions. No és igual al terme preferit (Preferred Term), que
també es troba a la Taula de Descripcions. La descripció completa
explica el significat del concepte amb major detall que el terme
preferit per a eliminar o disminuir l‟ambigüitat.
CTV3ID El Código Read per aquest concepte.
SNOMEDID L‟identificador de SNOMED per aquest concepte.
IsPrimitive Indica si el concepte és primitiu o completament definit pel seu
conjunt actual de característiques definitòries.
30 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Subconjunt SNOMED CT -> Taula de descripcions: Cada fila de la Taula de Descripcions
associa un terme amb un concepte mèdic; aquest terme es pot utilitzar per representar el
concepte. Cada descripció te el seu identificador únic i amés, el text d‟un terme i
l‟identificador del concepte que pot representar.
Camps clau
DescriptionId L‟identificador únic de SNOMED Clinical Terms per a aquesta
descripció. L‟identificador únic de SNOMED Clinical Terms per a
aquest concepte.
Camps de dades
DescriptionStatus L‟estat d‟una descripció indica si es troba en us actiu i, pel contrari,
el motiu del seu retirament.
ConceptId L‟identificador únic de SNOMED CT del concepte associat.
Term El text d‟un terme utilitzat per descriure el concepte associat.
InitialCapitalStatus Una indicació que assenyala si la majúscula del primer caràcter del
terme és significativa.
DescriptionType Una indicació que assenyala si el terme és la descripció completa,
el terme preferit o un sinònim del concepte al qual s‟aplica la
descripció.
LanguageCode Una indicació de l‟idioma o dialecte en el qual la descripció és
vàlida. El subconjunt de l‟idioma o dialecte finalment defineix les
descripcions per a cada concepte.
Per a identificar les descripcions d‟una edició en qualsevol idioma s‟ha d‟utilitzar el
subconjunt d‟idioma apropiat. La Taula de Descripcions no s‟ha d‟utilitzar sola. Les
descripcions per cada edició en un idioma determinat (inclòs l‟anglès) es designen al
subconjunt.
SNOMED CT -> Taula de Relacions: Cada fila de la Taula de Relacions representa una
relació entre dos conceptes. El tipus de relació s‟identifica per la referència a un altre
concepte.
31 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
Camps clau
RelationshipId L‟identificador únic de SNOMED Clinical Terms per aquesta
descripció. L‟identificador únic de SNOMED Clinical Terms per
aquest concepte.
Camps de dades
ConceptId1 L‟identificador únic de SNOMED CT del concepte que és el
concepte d‟origen d‟aquesta relació.
RelationshipType L‟identificador únic de SNOMED CT del concepte que representa
el tipus de relació entre els conceptes relacionats.
ConceptId2 L‟identificador únic de SNOMED CT del concepte que és el
concepte de destí d‟aquesta relació.
CharacteristicType Una indicació que assenyala si una relació especifica una
característica definitòria del concepte d‟origen o una possible
característica qualificativa d‟aquest concepte.
Refinability Una indicació que estableix si és possible refinar el concepte de
destí quan s‟utilitza aquesta relació com plantilla per a l‟ ingrés de
dades mèdiques.
RelationshipGroup Un número enter que vincula entre sí les relacions que formen part
d‟un grup de relacions associades lògicament.
La Taula de Relacions reuneix les definicions, qualificadors i fets addicionals sobre un
concepte. Tot i que també es pot utilitzar per a desplegar una jerarquia de subtipus, no té un
ordre d‟exposició especificat o natural. L‟ordenament es basa en la utilització d‟un
subconjunt de navegació (veure Introducció al mecanisme de subconjunts).
A les versions de SNOMED CT de 2003 i 2004 alguns tipus de relacions van estar
distribuïdes en un arxiu separat anomenat Taula de Relacions Històriques. Aquestes
relacions s‟han incorporat a la Taula de Relacions genèrica partint de la versió de Gener del
2005.
4. Referències
En aquest document es fa referència i s‟ha usat text dels següents documents:
32 de 37
Criteris de conformitat, sistemes de Anatomia Patologica Criteris per la conformitat amb la interoperabiitat dels sistemes de Anatomia Patologica
SNOMED Clinical Terms ® Guía del Usuario, Edición Internacional Enero 2008 SNOMED Clinical Terms ® Guía de Referencia Técnica, Edición Internacional Enero 2008.
Recomanem ampliar informació fent ús d‟aquests documents, així com complementar amb
la llei de protecció de dades.