Enzimas clase

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LOS BIOCATALIZADORES

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LOS BIOCATALIZADORES

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Catalizadores

• Las células poseen compuestos químicos que controlan las reacciones que ocurren en su interior.

• La sustancia que controla la velocidad a la que ocurre una reacción química sin que la célula sufra daño alguno ni se destruya se conoce como un catalizador.

• Las enzimas son proteínas que actúan como catalizadores en las células.

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Enzimas• Hacen posibles las reacciones,

disminuyendo la cantidad de energía de activación que se necesita.

• Controlan la velocidad a la que ocurre la reacción, para que la energía se libere lentamente.

• Permiten que las reacciones ocurran a unas temperaturas que no hagan daño al organismo.

¿Cuántas enzimas habrán en un organismo?

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Enzimas y sustratos

• La sustancia sobre la cual actúa una enzima se conoce como sustrato.– El sustrato se convierte en uno o más productos nuevos.

• Las enzimas son reutilizables y cada una puede catalizar de 100 a 30,000,000 de reacciones por min.

• Pero, una enzima particular actúa solo sobre un sustrato específico.– Cada enzima particular puede controlar solo un tipo de reacción.

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La unión del sustrato produce un cambio conformacional de la enzima hexoquinasa (cinasa), la cual es monomérica.

Substrato de glucosa

Sitio de enlace

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PROPIEDADES GENERALES• AUMENTAN LA VELOCIDAD DE REACCIÓN

– De 106 to 1012 veces vs sin enzima.– Aún más rápido que los catalizadores químicos.

• CONDICIONES DE REACCIÓN– Temperatura 25-40 oC (algunas hasta 75 oC)– pH neutro (5-9), la mayoría 6.5 – 7.5– Presión atmosférica normal

• CAPACIDAD DE REGULACIÓN– Por concentración de sustrato– Por concentración de enzima– Por inhibidores competitivos (semejantes al sustrato)– Por inhibidores no competitivos (modificación covalente de la enzima)– Por regulación alostérica

• ALTA ESPECIFICIDAD DE REACCIÓN– Interacción estereoespecífica con el sustrato– No hay productos colaterales

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ALTA ESPECIFICIDAD DE REACCIÓN

INTERACCIÓNESTEREOESPECÍFICA CON SU SUSTRATO

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Enzimas y coenzimas

• Una enzima recibe el nombre del sustrato sobre el cual actúa.– A una parte del nombre del sustrato se

le añade el sufijo –asa. ¿Cuál será el sustrato de una proteasa?

• En algunas reacciones, pequeñas moléculas, llamadas coenzimas, se unen a las enzimas para controlar las reacciones.– Las coenzimas no son proteínas pero

no sufren cambios durante las reacciones.

– Algunas vitaminas son coenzimas. B1, B2, B6, K.

– Una reacción no ocurrirá si la coenzima no está presente.

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Los modelos de enzimas• La forma y la estructura de una enzima determinan la reacción que

puede catalizar.• La enzima se une al sustrato (S) mediante un área especial, el sitio

activo, para formar un complejo enzima-sustrato o E-S.• En el sitio activo, la enzima y el sustrato se ajustan perfectamente.

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• Modelo del ajuste inducido.

• Modelo de la llave y la cerradura.

Los modelos de enzimas

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Las células regulan la cantidad y la actividad de sus enzimas

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Se realiza la reacción catalítica

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Inhibición por retroalimentación

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Los factores que afectan la actividad enzimática

• La temperatura (desnaturalización) (Ej: albúmina)

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Los factores que afectan la actividad enzimática

El pH (desnaturalización) (Ej: pepsina)

La concentración del sustrato

Sustancias químicas (inhibidores)

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Coenzimas y Cofactores Enzimáticos

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ENZIMAS Y COENZIMAS

La capacidad catalítica de los enzimas está limitada por las propiedades de los grupos funcionales de los aminoácidos del Centro Activo

Acidos y Bases Transferencia de H+

Nucleófilos Transferencia de grupos

Cuando los cambios químicos no pueden ser producidos porlos resíduos de los aminoácidos, los enzimas actúan con la cooperación de pequeñas moléculas orgánicas o iones metálicos

COFACTORES ENZIMATICOS O COENZIMAS

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COFACTORES ENZIMATICOS Y COENZIMAS

Cofactor enzimático: Componente no proteico que actúa coordinadamente con un enzima para catalizar una reacción bioquímica HOLOENZIMA = APOENZIMA+COFACTOR

Molécula orgánicaCOENZIMA

Ión metálico

Unido por enlace covalenteGRUPO PROSTETICO

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Acido Pantoténico Acido LipóicoBiocitina

Tiamina PP

N

NN

NC

C

Co

Cobalamina

N

H

NAD/NADH+

FMN/FMNH2

GRUPOS FUNCIONALES DE COENZIMAS

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CARACTERISTICAS GENERALES DE LOS COENZIMAS

1. Bajo peso molecular, similar al de los sustratos metabólicos

2. Termoestables

3. Se encuentran a baja concentración en las células

4. Pueden ser compartidos por muchos enzimas diferentes

5. Pueden modificarse y no recuperarse en la misma reacción: Cosustratos

6. Son heterociclos o ciclos con electrones muy móviles

7. Poseen una extraordinaria reactividad

8. En su mayoría son de origen vitamínico

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CLASIFICACION DE COENZIMAS

1. CRITERIO NUTRICIONAL:- Origen vitamínico- Origen no vitamínico2. CRITERIO FUNCIONAL:- Coenzimas de transporte de grupos- Coenzimas de transporte de electrones

3. CRITERIO ENZIMOLOGICO:- Según el tipo de reacción en que participan

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COENZIMAS Y VITAMINAS

Vitaminas: Sustancias orgánicas presentes en los alimentos naturales,que no pueden ser sintetizadas significativamente por el organismo y que se requieren en pequeñas cantidades para el funcionamiento metabólico

Vitaminas liposolubles

Vitaminas hidrosolubles

La mayor parte de coenzimas son formas modificadas de vitaminas hidrosolubles

Avitaminosis oEnfermedades carenciales

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COENZIMAS DE TRANSFERENCIA DE ELECTRONES

e-

e-

e-e-

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COENZIMAS DE TRANSFERENCIA DE GRUPOS

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CARACTERISTICAS Y FUNCIONES DE LOS PRINCIPALES COENZIMAS

COENZIMACoenzima A

Biocitina

Acido lipoico

Tiamina Pirofosfato

Piridoxal Fosfato

5´-desoxiadenosil Cobalamina

Tetrametil hidrofolato

NAD+/NADH

NADP+/NADPH

FMN/FMNH2

FAD/FADH2

VITAMINAAcido Pantoténico

Biotina (vit H)

---

Tiamina (vit B1)

Piridoxal (vit B6)

Cobalamina (vit B12)

Acido fólico

Niacina (vit B3)

Riboflavina (vit B2)

REACCIONESActivación de acilosTransferencia de acilos

Fijación de CO2/CO3H-

Carboxilación

Transferencia simultáneade acilos y electrones

Rotura de enlaces C-C

Transaminaciones, a-descarboxilaciones, Racemizaciones

Reordenamientos inter-moleculares

Transferencia de grupos C-

Transferencia de electrones

Transferencia de electrones

METABOLISMOb-oxidaciónSíntesis de ac. GrasosDescarboxilación de aminoácidos

Carboxilasas: etapas iniciales de la gluconeogénesis y síntesis de ác. grasos

Descarboxilación de a-cetoácidos

Descarboxilación de a-cetoácidos

TransaminasasGlucógeno fosforilasa

Mutasas

Biosíntesis de purinasInhibido por metotrexate

Transferencia de 1 electrón

Transferencia de 2 electrones

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COFACTORES METALICOS

1. Presentan elevada concentración de carga positiva

2. Poseen valencias dirigidas: interacción con varios ligandos

3. Pueden existir en dos o más estados de valencia

4. Los más importantes cofactores son los metales de transición

N

N

N

N

Fe

CH3

HOOC

HOOC

CH3

H3C

H3C

Mn Co

Fe Cu

Zn Mo

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COFACTORES METALICOS

METAL(Valencia)

Mn (II)

Fe (III)

Co (III)

Cu (II)

Zn (II)

Mo (V)

Configuracion

3d5

3d5

3d6

3d9

3d10

4d1

Número de coordinación

4

46

6

4

4 / 5

6 / 5

Estereoquímica

Tetraedro

TetraedroOctaedro

Octaedro

Tetraedro

TetraedroBipiramide trigonalOctaedroBipirámide trigonal

Ejemplo

Piruvato deshidrogenasa

Coenzimas Fe-SCitocromos

Vitamina B12

Citocromos

CarboxipeptidasasPolimerasasProteínas reguladoras

Nitrogenasa

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Leonor Michelis y Maud Menten (1913)

Tiempo

Con

cent

.

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ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN

Vo = V max [S]

Km + [S]

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Cinética enzimática en función de la concentración de sustrato

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Vmax

KM

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La KM es un parámetro de Actividad Enzimática

• La KM es inversamente proporcional con la actividad de la enzima.

• Valor de KM grande, baja actividad

• Valor de KM pequeño, alta activida

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Determinación Cuantitativa de la Cinética Enzimática

1. La reacción global

2. Procedimeinto analítico para determinar elS que desaparece o el P que aparece

3. Sí el E requiere Cofactores (iónes o coenzimas)

4. La dependencia de la actividad enzimática con la [S] o se la KM del S.

5. El pH óptimo

6. Un intervalo de temperatura en la que la E es estable y muestra actividad elevada.

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Actividad enzimática y variación del pH

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1 3 7 11 14 pH

VoPepsina 1.5Tripsina 7.7Catalasa 7.6Arginasa 9.7Fumarasa 7.8Ribonucleasa 7.8

Enzima pH óptimo

4 37 85 Temperatura oC)

Vo

10 50 100 Coenzima

Vo

10 30 50 70 100 Tiempo (min)

Vo

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1.0 Unidad de Actividad Enzimática (U):

La cantidad que transforma 1.0 mmol (10-6 M) de S /min, a 25 0C, en las condiciones de medida óptima.

Actividad específica:

Es el no. de U de una E / mg de proteína.Es decir: una medida de la pureza de la E.Al purificarla, el valor llega a un máximo y es estable.

Número de recambio

No. de moléculas de S transformadas /unidad de tiempo, por una molécula de E ( o por un solo sitio catalítico)

Enzima No. de RecambioAnhidrasa carbónica 36 000 000B-Amilasa 1 000 000B-Galactosidasa 12 000Fosfoglucomutasa 1 240

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¿Vmax?

¿KM?

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Cuando:

Vo= Vmax Todos los sitios activos están ocupados y no hay moléculas de E libre.

KM= [S] Sí... ½ Vmax

KM representa la cantidad de sustrato necesaria para fijarse a la mitad de la E disponible y producir la mitad de la Vmax

KM representa la concentración del sustrato en una célula

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Inhibidores

Reactivos químicos específicos que pueden inhibir a la mayor parte de las enzimas.

INHIBIDORESIrreversibles

Reversibles

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Inhibidor Irreversible

• Inhibición permanente• Unión irreversible por medio de enlaces covalentes.• Modificaciones químicas de los gps. catalíticos. • Modificada la enzima, está siempre inhibida.

Para distinguirlo de los reversible se someten a diálisis y si no se separan enzima e inhibidor, éste es permanente.

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El inhibidor NO se une al sitio activo

Inhibición No Competitiva

NO se puede revertir con un exceso de sustrato

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Inhibición acompetitiva

I

El inhibidor se une a una SUBUNIDAD reguladora

La subunidad catalítica une al sustrato y cataliza la reacción

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