Enzimas clase
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LOS BIOCATALIZADORES
Catalizadores
• Las células poseen compuestos químicos que controlan las reacciones que ocurren en su interior.
• La sustancia que controla la velocidad a la que ocurre una reacción química sin que la célula sufra daño alguno ni se destruya se conoce como un catalizador.
• Las enzimas son proteínas que actúan como catalizadores en las células.
Enzimas• Hacen posibles las reacciones,
disminuyendo la cantidad de energía de activación que se necesita.
• Controlan la velocidad a la que ocurre la reacción, para que la energía se libere lentamente.
• Permiten que las reacciones ocurran a unas temperaturas que no hagan daño al organismo.
¿Cuántas enzimas habrán en un organismo?
Enzimas y sustratos
• La sustancia sobre la cual actúa una enzima se conoce como sustrato.– El sustrato se convierte en uno o más productos nuevos.
• Las enzimas son reutilizables y cada una puede catalizar de 100 a 30,000,000 de reacciones por min.
• Pero, una enzima particular actúa solo sobre un sustrato específico.– Cada enzima particular puede controlar solo un tipo de reacción.
La unión del sustrato produce un cambio conformacional de la enzima hexoquinasa (cinasa), la cual es monomérica.
Substrato de glucosa
Sitio de enlace
PROPIEDADES GENERALES• AUMENTAN LA VELOCIDAD DE REACCIÓN
– De 106 to 1012 veces vs sin enzima.– Aún más rápido que los catalizadores químicos.
• CONDICIONES DE REACCIÓN– Temperatura 25-40 oC (algunas hasta 75 oC)– pH neutro (5-9), la mayoría 6.5 – 7.5– Presión atmosférica normal
• CAPACIDAD DE REGULACIÓN– Por concentración de sustrato– Por concentración de enzima– Por inhibidores competitivos (semejantes al sustrato)– Por inhibidores no competitivos (modificación covalente de la enzima)– Por regulación alostérica
• ALTA ESPECIFICIDAD DE REACCIÓN– Interacción estereoespecífica con el sustrato– No hay productos colaterales
ALTA ESPECIFICIDAD DE REACCIÓN
INTERACCIÓNESTEREOESPECÍFICA CON SU SUSTRATO
Enzimas y coenzimas
• Una enzima recibe el nombre del sustrato sobre el cual actúa.– A una parte del nombre del sustrato se
le añade el sufijo –asa. ¿Cuál será el sustrato de una proteasa?
• En algunas reacciones, pequeñas moléculas, llamadas coenzimas, se unen a las enzimas para controlar las reacciones.– Las coenzimas no son proteínas pero
no sufren cambios durante las reacciones.
– Algunas vitaminas son coenzimas. B1, B2, B6, K.
– Una reacción no ocurrirá si la coenzima no está presente.
Los modelos de enzimas• La forma y la estructura de una enzima determinan la reacción que
puede catalizar.• La enzima se une al sustrato (S) mediante un área especial, el sitio
activo, para formar un complejo enzima-sustrato o E-S.• En el sitio activo, la enzima y el sustrato se ajustan perfectamente.
• Modelo del ajuste inducido.
• Modelo de la llave y la cerradura.
Los modelos de enzimas
Las células regulan la cantidad y la actividad de sus enzimas
Se realiza la reacción catalítica
Inhibición por retroalimentación
Los factores que afectan la actividad enzimática
• La temperatura (desnaturalización) (Ej: albúmina)
Los factores que afectan la actividad enzimática
El pH (desnaturalización) (Ej: pepsina)
La concentración del sustrato
Sustancias químicas (inhibidores)
Coenzimas y Cofactores Enzimáticos
ENZIMAS Y COENZIMAS
La capacidad catalítica de los enzimas está limitada por las propiedades de los grupos funcionales de los aminoácidos del Centro Activo
Acidos y Bases Transferencia de H+
Nucleófilos Transferencia de grupos
Cuando los cambios químicos no pueden ser producidos porlos resíduos de los aminoácidos, los enzimas actúan con la cooperación de pequeñas moléculas orgánicas o iones metálicos
COFACTORES ENZIMATICOS O COENZIMAS
COFACTORES ENZIMATICOS Y COENZIMAS
Cofactor enzimático: Componente no proteico que actúa coordinadamente con un enzima para catalizar una reacción bioquímica HOLOENZIMA = APOENZIMA+COFACTOR
Molécula orgánicaCOENZIMA
Ión metálico
Unido por enlace covalenteGRUPO PROSTETICO
Acido Pantoténico Acido LipóicoBiocitina
Tiamina PP
N
NN
NC
C
Co
Cobalamina
N
H
NAD/NADH+
FMN/FMNH2
GRUPOS FUNCIONALES DE COENZIMAS
CARACTERISTICAS GENERALES DE LOS COENZIMAS
1. Bajo peso molecular, similar al de los sustratos metabólicos
2. Termoestables
3. Se encuentran a baja concentración en las células
4. Pueden ser compartidos por muchos enzimas diferentes
5. Pueden modificarse y no recuperarse en la misma reacción: Cosustratos
6. Son heterociclos o ciclos con electrones muy móviles
7. Poseen una extraordinaria reactividad
8. En su mayoría son de origen vitamínico
CLASIFICACION DE COENZIMAS
1. CRITERIO NUTRICIONAL:- Origen vitamínico- Origen no vitamínico2. CRITERIO FUNCIONAL:- Coenzimas de transporte de grupos- Coenzimas de transporte de electrones
3. CRITERIO ENZIMOLOGICO:- Según el tipo de reacción en que participan
COENZIMAS Y VITAMINAS
Vitaminas: Sustancias orgánicas presentes en los alimentos naturales,que no pueden ser sintetizadas significativamente por el organismo y que se requieren en pequeñas cantidades para el funcionamiento metabólico
Vitaminas liposolubles
Vitaminas hidrosolubles
La mayor parte de coenzimas son formas modificadas de vitaminas hidrosolubles
Avitaminosis oEnfermedades carenciales
COENZIMAS DE TRANSFERENCIA DE ELECTRONES
e-
e-
e-e-
COENZIMAS DE TRANSFERENCIA DE GRUPOS
CARACTERISTICAS Y FUNCIONES DE LOS PRINCIPALES COENZIMAS
COENZIMACoenzima A
Biocitina
Acido lipoico
Tiamina Pirofosfato
Piridoxal Fosfato
5´-desoxiadenosil Cobalamina
Tetrametil hidrofolato
NAD+/NADH
NADP+/NADPH
FMN/FMNH2
FAD/FADH2
VITAMINAAcido Pantoténico
Biotina (vit H)
---
Tiamina (vit B1)
Piridoxal (vit B6)
Cobalamina (vit B12)
Acido fólico
Niacina (vit B3)
Riboflavina (vit B2)
REACCIONESActivación de acilosTransferencia de acilos
Fijación de CO2/CO3H-
Carboxilación
Transferencia simultáneade acilos y electrones
Rotura de enlaces C-C
Transaminaciones, a-descarboxilaciones, Racemizaciones
Reordenamientos inter-moleculares
Transferencia de grupos C-
Transferencia de electrones
Transferencia de electrones
METABOLISMOb-oxidaciónSíntesis de ac. GrasosDescarboxilación de aminoácidos
Carboxilasas: etapas iniciales de la gluconeogénesis y síntesis de ác. grasos
Descarboxilación de a-cetoácidos
Descarboxilación de a-cetoácidos
TransaminasasGlucógeno fosforilasa
Mutasas
Biosíntesis de purinasInhibido por metotrexate
Transferencia de 1 electrón
Transferencia de 2 electrones
COFACTORES METALICOS
1. Presentan elevada concentración de carga positiva
2. Poseen valencias dirigidas: interacción con varios ligandos
3. Pueden existir en dos o más estados de valencia
4. Los más importantes cofactores son los metales de transición
N
N
N
N
Fe
CH3
HOOC
HOOC
CH3
H3C
H3C
Mn Co
Fe Cu
Zn Mo
COFACTORES METALICOS
METAL(Valencia)
Mn (II)
Fe (III)
Co (III)
Cu (II)
Zn (II)
Mo (V)
Configuracion
3d5
3d5
3d6
3d9
3d10
4d1
Número de coordinación
4
46
6
4
4 / 5
6 / 5
Estereoquímica
Tetraedro
TetraedroOctaedro
Octaedro
Tetraedro
TetraedroBipiramide trigonalOctaedroBipirámide trigonal
Ejemplo
Piruvato deshidrogenasa
Coenzimas Fe-SCitocromos
Vitamina B12
Citocromos
CarboxipeptidasasPolimerasasProteínas reguladoras
Nitrogenasa
Leonor Michelis y Maud Menten (1913)
Tiempo
Con
cent
.
ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN
Vo = V max [S]
Km + [S]
Cinética enzimática en función de la concentración de sustrato
Vmax
KM
La KM es un parámetro de Actividad Enzimática
• La KM es inversamente proporcional con la actividad de la enzima.
• Valor de KM grande, baja actividad
• Valor de KM pequeño, alta activida
Determinación Cuantitativa de la Cinética Enzimática
1. La reacción global
2. Procedimeinto analítico para determinar elS que desaparece o el P que aparece
3. Sí el E requiere Cofactores (iónes o coenzimas)
4. La dependencia de la actividad enzimática con la [S] o se la KM del S.
5. El pH óptimo
6. Un intervalo de temperatura en la que la E es estable y muestra actividad elevada.
Actividad enzimática y variación del pH
1 3 7 11 14 pH
VoPepsina 1.5Tripsina 7.7Catalasa 7.6Arginasa 9.7Fumarasa 7.8Ribonucleasa 7.8
Enzima pH óptimo
4 37 85 Temperatura oC)
Vo
10 50 100 Coenzima
Vo
10 30 50 70 100 Tiempo (min)
Vo
1.0 Unidad de Actividad Enzimática (U):
La cantidad que transforma 1.0 mmol (10-6 M) de S /min, a 25 0C, en las condiciones de medida óptima.
Actividad específica:
Es el no. de U de una E / mg de proteína.Es decir: una medida de la pureza de la E.Al purificarla, el valor llega a un máximo y es estable.
Número de recambio
No. de moléculas de S transformadas /unidad de tiempo, por una molécula de E ( o por un solo sitio catalítico)
Enzima No. de RecambioAnhidrasa carbónica 36 000 000B-Amilasa 1 000 000B-Galactosidasa 12 000Fosfoglucomutasa 1 240
¿Vmax?
¿KM?
Cuando:
Vo= Vmax Todos los sitios activos están ocupados y no hay moléculas de E libre.
KM= [S] Sí... ½ Vmax
KM representa la cantidad de sustrato necesaria para fijarse a la mitad de la E disponible y producir la mitad de la Vmax
KM representa la concentración del sustrato en una célula
Inhibidores
Reactivos químicos específicos que pueden inhibir a la mayor parte de las enzimas.
INHIBIDORESIrreversibles
Reversibles
Inhibidor Irreversible
• Inhibición permanente• Unión irreversible por medio de enlaces covalentes.• Modificaciones químicas de los gps. catalíticos. • Modificada la enzima, está siempre inhibida.
Para distinguirlo de los reversible se someten a diálisis y si no se separan enzima e inhibidor, éste es permanente.
El inhibidor NO se une al sitio activo
Inhibición No Competitiva
NO se puede revertir con un exceso de sustrato
Inhibición acompetitiva
I
El inhibidor se une a una SUBUNIDAD reguladora
La subunidad catalítica une al sustrato y cataliza la reacción