La taxonomía es la ciencia de la clasificación biológica

La clasificación, que es la ordenación de los seres vivos en grupos o taxones en función de semejanzas o parentesco evolutivo.

Comprende tres partes independientes pero relacionadas:

La nomenclatura, que se ocupa de asignar nombres a los grupostaxonómicos de acuerdo con normas establecidas.

La identificación, es el proceso para determinar que un aislamiento particular pertenece a un taxón reconocido. (es el lado práctico de la taxonomía)

TAXONOMÍA BACTERIANATAXONOMÍA BACTERIANA

Cont.

• Dominio– Actualmente

considerado el nivel taxonómico más alto (super-reinos).

– 3 dominos: Bacteria, Archaea, Eukarya

– Sistema de Woese (1990)

♦ Al preparar un sistema de clasificación, se ubican todos los microorganismos en grupos homogéneos, que a su vez pertenecen a otro grupo más extenso siguiendo una estructura jerárquica sin superposiciones.

♦ Una categoría de cualquier rango une grupos de nivel inferior en función de propiedades comunes.

♦ En la taxonomía bacteriana los niveles o rangos utilizados son los siguientes (en orden ascendente):

● ESPECIE ● GÉNERO ● FAMILIA ● ORDEN ● CLASE ● REINO ● DOMINIO

El grupo taxonómico básico es la ESPECIE

Definición de especie

ESPECIE es un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre si y que están aisladas de otros grupos desde el punto de vista de la reproducción.

ESPECIE BACTERIANA es una colección de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma significativa de otros grupos de cepas.

Una CEPA es una población de microorganismos que desciende de un único organismo o de un aislamiento en cultivo puro.

Cada especie se asigna a un GÉNERO, el siguiente rango de la jerarquía taxonómica.Un GÉNERO es un grupo bien definido de una o más especies que está claramente separado de otros géneros.

Para los taxónomos que trabajan con organismos superiores

Para los microbiólogos

NOMENCLATURA

☻Los microbiólogos asignan nombre a los microorganismos de acuerdo con el SISTEMA BINOMIAL del botánico sueco Carl Von Linneo.

☻ El nombre latinizado y en cursiva consta de dos partes:El primer nombre, escrito con mayúscula, es el nombre genérico.El segundo nombre, en minúscula, es el epíteto de la especie.

Escherichia coli

☻ A menudo se abrevia el nombre genérico con una letra mayúscula

E. coli

ESTRUCTURACIÓN JERÁRQUICA EN TAXONOMÍA

Rango Nombre taxonómico

Dominio

Phylum o Reino

Clase

Orden

Familia

Género

Especie

Bacteria

Proteobacteria

γ-Proteobacteria

Enterobacteriales

Enterobacteriaceae

Shigella

S. dysenteriae

SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN

☺Las características taxonómicas de los microorganismos se utilizan para formar un sistema de clasificación.

☺ Existen dos formas generales para elaborar un sistema de clasificación:SISTEMA FENÉTICO☺ Los microorganismos se agrupan en función de semejanzas en sus características fenotípicas.☺Los microorganismos que comparten muchas características forman un único taxón.

SISTEMA FILOGENÉTICO☺Los microorganismos se agrupan en función de probables relaciones evolutivas.☺Es difícil de realizar para las bacterias debido a la falta de registros fósiles.

PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN TAXONOMÍA BACTERIANA

CARACTERÍSTICASCLÁSICAS

MORFOLÓGICAS Forma celularTamaño de las célulasMorfología de las coloniasCaracterísticas ultraestructuralesTinciónCilios y flagelosMecanismo de movilidadForma y localización de endoesporasInclusiones celularescolor

FISIOLOGICAS Y METABÓLICAS

Fuentes de C y NComponentes de la pared celularFuentes de energíaProductos de fermentaciónTipo nutricionalTemperatura de crecimientoLuminiscenciaMecanismo de conversión de energíaMovilidadTolerancia osmóticaRelaciones con el oxígenopH óptimo de crecimientoPigmentos fotosintéticosNecesidad y tolerancia a la salMetabolitos secundariosSensibilidad a antibióticos

ECOLÓGICAS

Ciclo vitalRelaciones simbióticasPatogenicidadPreferencia de hábitatNecesidad de temperatura; pH;Necesidad de oxígenoNecesidad de concentración osmótica

GENÉTICAS

Posibilidad de recombinación porConjugación oTransformación

Plásmidos

Identificación de una bacteria entérica mediante técnicas microbiológicas clásicas utilizando exclusivamente criterios fenotípicos.La mayoría de los pasos a seguir requieren que el microorganismo crezca en cultivo puro.

PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS APLICADAS EN TAXONOMÍA BACTERIANA

CARACTERÍSTICASMOLECULARES

COMPARACIÓN DE PROTEÍNAS

HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOSSECUENCIACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS

COMPOSICIÓN DE ÁCIDOS NUCLÉICOS(CONTENIDO EN G+C)

Estructura secundaria del ARNr 16/18 S de los tres Dominios

☺ Los puntos rojos señalan posiciones en las que arqueas y bacterias suelen diferir

Bacteria Archaea Eucarya

Árbol filogenético de todos los seres vivos

Característica Bacteria Archaea Eukarya

- Estructura celular procariótica

- ADN circular

- Histonas

- Núcleo rodeado de membrana

Sí

Sí

No

Ausente

Sí

Sí

Sí

Ausente

No

No

Sí

Presente

- Pared celular de peptidoglicano

- Lípidos de membrana

- Ribosomas

- Intrones

Sí

Enlaces éster

70S

No

No

Enlaces éter

70S

No

No

Enlaces éster

80S

Sí

- Plásmidos

- Sensibilidad de ribosomas a la toxina diftérica

- Sensibilidad a cloranfenicol, estreptomicina y kanamicina

Si

No

Sí

Sí

Sí

No

Raro

Sí

No

- Metanogénesis

- Reducción desasimilativa de sulfatos y férrico

- Nitrificación

- Desnitrificación

No

Sí

Sí

Sí

Sí

Sí

No

Sí

No

No

No

No

- Fijación de nitrógeno

- Fotosíntesis oxigénica

- Quimiolitotrofía

- Vesículas de gas

- Sintesis de gránulos de reserva de carbono (β-hidroxialcanoatos)

- Crecimiento por encima de 80º

Sí

Sí

Sí

Sí

Sí

Sí

Sí

No

Sí

Sí

Sí

Sí

No

Sí (en cloroplastos)

No

No

No

No

Resumen de las principales características diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya

Arbol filogenético de los principales linajes de Bacteria basado

en la comparación de secuencias de ARNr 16S